Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTNSO60931 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTNSO60931 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNSO60931 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNSO60931 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNSO60931 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms