Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZIC3O60481 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZIC3O60481 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms