Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPLO60437 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PPLO60437 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPLO60437 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPLO60437 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPLO60437 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPLO60437 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPLO60437 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPLO60437 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPLO60437 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPLO60437 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms