Protein–RNA interactions for Protein: O43448

KCNAB3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB3O43448 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KCNAB3O43448 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNAB3O43448 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms