Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEFVO15553 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEFVO15553 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEFVO15553 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEFVO15553 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEFVO15553 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEFVO15553 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEFVO15553 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms