Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGFO15240 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGFO15240 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGFO15240 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGFO15240 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGFO15240 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
VGFO15240 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VGFO15240 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VGFO15240 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
VGFO15240 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGFO15240 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGFO15240 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGFO15240 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGFO15240 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms