Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPATO15228 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPATO15228 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPATO15228 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPATO15228 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPATO15228 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPATO15228 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GNPATO15228 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GNPATO15228 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNPATO15228 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms