Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP290O15078 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP290O15078 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP290O15078 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP290O15078 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP290O15078 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms