Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3EO15041 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3EO15041 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms