Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2AO14813 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms