Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD8O14715 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD8O14715 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms