Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB6O14558 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms