Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SYT5O00445 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SYT5O00445 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms