Protein–RNA interactions for Protein: O00341

SLC1A7, Excitatory amino acid transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A7O00341 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC1A7O00341 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms