Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3CDO00329 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3CDO00329 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms