Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP1O00294 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP1O00294 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP1O00294 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP1O00294 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms