Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01387J3KSC0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC01387J3KSC0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms