Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KR12 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KR12 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KR12 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KR12 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3KR12 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3KR12 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3KR12 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3KR12 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3KR12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3KR12 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3KR12 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms