Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCER2I3L3R5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCER2I3L3R5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms