Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H7C1W4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H7C1W4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H7C1W4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1W4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1W4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1W4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1W4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
H7C1W4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H7C1W4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H7C1W4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H7C1W4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H7C1W4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms