Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GOLGA8SH3BPF8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms