Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVV-2B6SEH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms