Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC69A6NI79 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC69A6NI79 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms