Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MBD3L3A6NE82 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MBD3L3A6NE82 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms