Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms