Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM3A6NDB9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms