Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VWA3AA6NCI4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VWA3AA6NCI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms