Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF22A3QJZ6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF22A3QJZ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms