Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0D9SFI3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0D9SFI3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms