Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 PPWD1-215ENST00000538977 2055 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC135731.2-201ENST00000603029 2098 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 LSM5-208ENST00000450169 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 RETNLB-201ENST00000295755 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC074254.1-201ENST00000399152 404 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CNOT4P1-201ENST00000417432 1199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC006460.1-201ENST00000421437 808 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 RPL36P2-201ENST00000426026 315 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 MYL6BP1-201ENST00000429485 615 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC073346.1-202ENST00000430610 544 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC073254.1-202ENST00000447488 640 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 SPATA24-203ENST00000451821 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 MCHR2-AS1-204ENST00000452482 821 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 NDUFB11P1-201ENST00000455818 465 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC093297.2-201ENST00000503452 738 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 C5orf58-202ENST00000517575 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 IGHV3-36-201ENST00000520848 401 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 PCED1B-AS1-204ENST00000547851 780 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC005871.2-201ENST00000549104 526 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC005632.1-201ENST00000550637 576 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC020779.2-201ENST00000568984 393 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.165-201ENST00000615681 260 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC234791.1-201ENST00000620830 1203 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CU633967.1-202ENST00000623449 560 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 CU638689.5-201ENST00000623892 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 SOX5-203ENST00000396007 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 IKZF3-214ENST00000467757 1362 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 GPBP1-208ENST00000514387 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AL109918.1-201ENST00000602367 3039 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
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PDCD1Q15116 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AKAP3-201ENST00000228850 3339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PDCD1Q15116 EXOSC9-211ENST00000512454 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HEATR5A-201ENST00000382464 507 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 B4GALT6-203ENST00000383131 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 KRBOX1-201ENST00000383748 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 EGFLAM-205ENST00000397210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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