Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCOA3Q9Y6Q9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCOA3Q9Y6Q9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms