Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA3Q9Y6H8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms