Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00312Q9Y6C7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00312Q9Y6C7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms