Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms