Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GINS2Q9Y248 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GINS2Q9Y248 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms