Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF9BQ9UPX0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms