Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS4AQ9UN37 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS4AQ9UN37 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms