Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB23Q9ULC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB23Q9ULC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms