Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC9Q9UKV0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HDAC9Q9UKV0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms