Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MID2Q9UJV3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MID2Q9UJV3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms