Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CYTH4Q9UIA0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTH4Q9UIA0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms