Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX25Q9UHL0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX25Q9UHL0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX25Q9UHL0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX25Q9UHL0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX25Q9UHL0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX25Q9UHL0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms