Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIP2Q9UDT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLIP2Q9UDT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms