Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APEX2Q9UBZ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms