Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLN8Q9UBY8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLN8Q9UBY8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms