Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GABBR1Q9UBS5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABBR1Q9UBS5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms