Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COPG2Q9UBF2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms