Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL42Q9P2K6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KLHL42Q9P2K6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms