Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SIPA1L2Q9P2F8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIPA1L2Q9P2F8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms