Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
MBD5Q9P267 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MBD5Q9P267 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MBD5Q9P267 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms